La carenza di vitamina B12 dà luogo ad una particolare forma di anemia detta anemia perniciosa. Si tratta di una anemia megaloblastica, associata cioè alla comparsa di grosse cellule rosse immature nel sangue. Una sintomatologia simile è anche data da una carenza di acido folico. L’anemia perniciosa di solito non è collegata ad una carenza della vitamina nella dieta, ma ad una impossibilità di assorbirla per mancata secrezione da parte dello stomaco del “”fattore intrinseco”", essenziale per l’assorbimento. Si tratta di una forma comune nei pazienti gastroresecati, che abbisognano di solito di periodiche somministrazioni di vitamina B12.